Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGGP02679 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGGP02679 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGGP02679 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGGP02679 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGGP02679 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGGP02679 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGGP02679 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGGP02679 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGGP02679 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGGP02679 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGGP02679 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FGGP02679 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGGP02679 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGGP02679 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGGP02679 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGGP02679 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGGP02679 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGGP02679 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGGP02679 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGGP02679 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGGP02679 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGGP02679 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGGP02679 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGGP02679 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGGP02679 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGGP02679 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGGP02679 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGGP02679 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGGP02679 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FGGP02679 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGGP02679 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGGP02679 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGGP02679 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGGP02679 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGGP02679 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGGP02679 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGGP02679 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGGP02679 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGGP02679 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGGP02679 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGGP02679 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGGP02679 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGGP02679 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGGP02679 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGGP02679 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGGP02679 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGGP02679 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGGP02679 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGGP02679 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGGP02679 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGGP02679 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGGP02679 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGGP02679 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGGP02679 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGGP02679 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGGP02679 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGGP02679 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGGP02679 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGGP02679 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGGP02679 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FGGP02679 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGGP02679 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGGP02679 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGGP02679 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGGP02679 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGGP02679 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGGP02679 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGGP02679 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGGP02679 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGGP02679 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGGP02679 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGGP02679 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGGP02679 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGGP02679 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGGP02679 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGGP02679 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGGP02679 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGGP02679 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGGP02679 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGGP02679 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGGP02679 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGGP02679 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGGP02679 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGGP02679 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGGP02679 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FGGP02679 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGGP02679 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGGP02679 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGGP02679 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms