Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNB1P01574 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNB1P01574 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNB1P01574 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms