Protein–RNA interactions for Protein: O95970

LGI1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI1O95970 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI1O95970 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI1O95970 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI1O95970 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI1O95970 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI1O95970 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI1O95970 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI1O95970 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI1O95970 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI1O95970 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI1O95970 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI1O95970 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI1O95970 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI1O95970 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGI1O95970 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LGI1O95970 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LGI1O95970 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI1O95970 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI1O95970 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI1O95970 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI1O95970 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI1O95970 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI1O95970 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI1O95970 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI1O95970 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI1O95970 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGI1O95970 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGI1O95970 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGI1O95970 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGI1O95970 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI1O95970 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI1O95970 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI1O95970 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI1O95970 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI1O95970 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI1O95970 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI1O95970 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI1O95970 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI1O95970 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI1O95970 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI1O95970 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI1O95970 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI1O95970 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI1O95970 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI1O95970 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI1O95970 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI1O95970 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI1O95970 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI1O95970 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI1O95970 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI1O95970 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LGI1O95970 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LGI1O95970 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI1O95970 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI1O95970 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI1O95970 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI1O95970 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI1O95970 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI1O95970 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI1O95970 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI1O95970 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI1O95970 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI1O95970 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI1O95970 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI1O95970 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI1O95970 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI1O95970 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI1O95970 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI1O95970 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI1O95970 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI1O95970 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI1O95970 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms