Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX6O95503 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX6O95503 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX6O95503 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX6O95503 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX6O95503 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX6O95503 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX6O95503 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX6O95503 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX6O95503 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX6O95503 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX6O95503 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX6O95503 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX6O95503 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX6O95503 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX6O95503 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX6O95503 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX6O95503 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX6O95503 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX6O95503 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX6O95503 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX6O95503 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX6O95503 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX6O95503 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX6O95503 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX6O95503 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX6O95503 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX6O95503 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX6O95503 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX6O95503 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBX6O95503 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBX6O95503 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX6O95503 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX6O95503 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX6O95503 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX6O95503 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX6O95503 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX6O95503 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX6O95503 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX6O95503 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX6O95503 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX6O95503 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX6O95503 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX6O95503 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX6O95503 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBX6O95503 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX6O95503 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX6O95503 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX6O95503 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBX6O95503 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CBX6O95503 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX6O95503 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX6O95503 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX6O95503 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX6O95503 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX6O95503 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX6O95503 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX6O95503 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX6O95503 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX6O95503 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX6O95503 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX6O95503 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX6O95503 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX6O95503 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX6O95503 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX6O95503 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX6O95503 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX6O95503 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX6O95503 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX6O95503 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBX6O95503 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX6O95503 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX6O95503 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX6O95503 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX6O95503 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX6O95503 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX6O95503 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX6O95503 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX6O95503 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX6O95503 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX6O95503 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX6O95503 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX6O95503 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX6O95503 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX6O95503 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX6O95503 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX6O95503 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX6O95503 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX6O95503 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBX6O95503 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms