Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCA5LO95447 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LCA5LO95447 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LCA5LO95447 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCA5LO95447 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms