Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FARP2O94887 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FARP2O94887 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FARP2O94887 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FARP2O94887 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FARP2O94887 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FARP2O94887 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FARP2O94887 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FARP2O94887 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FARP2O94887 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FARP2O94887 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FARP2O94887 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FARP2O94887 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FARP2O94887 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FARP2O94887 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FARP2O94887 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FARP2O94887 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP2O94887 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP2O94887 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP2O94887 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP2O94887 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP2O94887 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP2O94887 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FARP2O94887 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FARP2O94887 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FARP2O94887 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FARP2O94887 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FARP2O94887 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FARP2O94887 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FARP2O94887 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FARP2O94887 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FARP2O94887 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FARP2O94887 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FARP2O94887 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FARP2O94887 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP2O94887 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP2O94887 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP2O94887 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP2O94887 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP2O94887 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP2O94887 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FARP2O94887 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FARP2O94887 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FARP2O94887 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FARP2O94887 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FARP2O94887 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FARP2O94887 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FARP2O94887 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FARP2O94887 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FARP2O94887 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FARP2O94887 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FARP2O94887 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FARP2O94887 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FARP2O94887 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FARP2O94887 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FARP2O94887 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FARP2O94887 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FARP2O94887 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FARP2O94887 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FARP2O94887 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FARP2O94887 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP2O94887 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP2O94887 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP2O94887 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP2O94887 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP2O94887 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP2O94887 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP2O94887 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP2O94887 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP2O94887 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FARP2O94887 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FARP2O94887 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FARP2O94887 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FARP2O94887 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FARP2O94887 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FARP2O94887 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FARP2O94887 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FARP2O94887 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FARP2O94887 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FARP2O94887 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FARP2O94887 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FARP2O94887 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FARP2O94887 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FARP2O94887 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FARP2O94887 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FARP2O94887 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FARP2O94887 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FARP2O94887 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FARP2O94887 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FARP2O94887 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FARP2O94887 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FARP2O94887 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FARP2O94887 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FARP2O94887 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FARP2O94887 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FARP2O94887 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FARP2O94887 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FARP2O94887 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FARP2O94887 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FARP2O94887 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms