Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC6AO75865 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC6AO75865 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC6AO75865 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC6AO75865 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms