Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP2O75604 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP2O75604 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP2O75604 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP2O75604 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP2O75604 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP2O75604 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP2O75604 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP2O75604 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP2O75604 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP2O75604 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP2O75604 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP2O75604 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP2O75604 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP2O75604 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP2O75604 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP2O75604 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP2O75604 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
USP2O75604 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP2O75604 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP2O75604 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP2O75604 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP2O75604 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP2O75604 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP2O75604 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP2O75604 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP2O75604 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP2O75604 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP2O75604 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP2O75604 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP2O75604 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP2O75604 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP2O75604 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP2O75604 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP2O75604 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP2O75604 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP2O75604 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP2O75604 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP2O75604 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP2O75604 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP2O75604 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP2O75604 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP2O75604 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP2O75604 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP2O75604 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP2O75604 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP2O75604 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP2O75604 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP2O75604 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP2O75604 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP2O75604 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP2O75604 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP2O75604 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP2O75604 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP2O75604 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP2O75604 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP2O75604 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP2O75604 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP2O75604 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP2O75604 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USP2O75604 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USP2O75604 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP2O75604 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP2O75604 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP2O75604 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP2O75604 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP2O75604 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP2O75604 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP2O75604 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP2O75604 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP2O75604 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP2O75604 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP2O75604 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP2O75604 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP2O75604 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP2O75604 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
USP2O75604 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP2O75604 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
USP2O75604 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP2O75604 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP2O75604 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP2O75604 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP2O75604 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP2O75604 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP2O75604 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP2O75604 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP2O75604 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP2O75604 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP2O75604 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP2O75604 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP2O75604 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP2O75604 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP2O75604 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP2O75604 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP2O75604 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP2O75604 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP2O75604 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP2O75604 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP2O75604 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP2O75604 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms