Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNSO60931 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNSO60931 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNSO60931 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNSO60931 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNSO60931 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNSO60931 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNSO60931 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNSO60931 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNSO60931 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNSO60931 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNSO60931 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNSO60931 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNSO60931 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNSO60931 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNSO60931 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNSO60931 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNSO60931 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNSO60931 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNSO60931 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNSO60931 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNSO60931 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNSO60931 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNSO60931 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNSO60931 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNSO60931 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNSO60931 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNSO60931 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNSO60931 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNSO60931 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNSO60931 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNSO60931 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNSO60931 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNSO60931 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNSO60931 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNSO60931 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNSO60931 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNSO60931 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNSO60931 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNSO60931 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNSO60931 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNSO60931 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNSO60931 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNSO60931 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNSO60931 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNSO60931 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNSO60931 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNSO60931 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNSO60931 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNSO60931 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNSO60931 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNSO60931 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNSO60931 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNSO60931 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNSO60931 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNSO60931 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNSO60931 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNSO60931 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNSO60931 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNSO60931 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNSO60931 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNSO60931 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNSO60931 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNSO60931 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNSO60931 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNSO60931 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNSO60931 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNSO60931 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNSO60931 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNSO60931 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNSO60931 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNSO60931 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNSO60931 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNSO60931 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNSO60931 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNSO60931 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNSO60931 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNSO60931 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNSO60931 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNSO60931 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNSO60931 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNSO60931 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNSO60931 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNSO60931 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNSO60931 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNSO60931 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNSO60931 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNSO60931 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNSO60931 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNSO60931 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNSO60931 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNSO60931 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNSO60931 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNSO60931 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNSO60931 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNSO60931 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNSO60931 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTNSO60931 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNSO60931 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTNSO60931 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms