Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF4O60810 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF4O60810 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF4O60810 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF4O60810 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms