Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL41O60662 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL41O60662 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL41O60662 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL41O60662 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms