Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCNT1O60563 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNT1O60563 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNT1O60563 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNT1O60563 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms