Protein–RNA interactions for Protein: O60294

LCMT2, tRNA wybutosine-synthesizing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT2O60294 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCMT2O60294 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LCMT2O60294 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCMT2O60294 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LCMT2O60294 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCMT2O60294 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms