Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDELR3O43731 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDELR3O43731 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDELR3O43731 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDELR3O43731 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDELR3O43731 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms