Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX1O43435 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX1O43435 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX1O43435 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX1O43435 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX1O43435 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX1O43435 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX1O43435 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX1O43435 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX1O43435 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX1O43435 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX1O43435 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX1O43435 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX1O43435 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX1O43435 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX1O43435 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX1O43435 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX1O43435 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX1O43435 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX1O43435 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX1O43435 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX1O43435 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TBX1O43435 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX1O43435 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX1O43435 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX1O43435 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX1O43435 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX1O43435 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX1O43435 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX1O43435 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX1O43435 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX1O43435 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX1O43435 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX1O43435 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX1O43435 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX1O43435 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX1O43435 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX1O43435 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX1O43435 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX1O43435 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX1O43435 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX1O43435 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX1O43435 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX1O43435 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX1O43435 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX1O43435 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX1O43435 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX1O43435 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX1O43435 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX1O43435 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX1O43435 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX1O43435 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX1O43435 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX1O43435 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX1O43435 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX1O43435 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX1O43435 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX1O43435 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX1O43435 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX1O43435 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX1O43435 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX1O43435 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX1O43435 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX1O43435 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX1O43435 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX1O43435 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX1O43435 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX1O43435 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX1O43435 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX1O43435 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX1O43435 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX1O43435 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX1O43435 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX1O43435 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX1O43435 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX1O43435 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX1O43435 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX1O43435 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX1O43435 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX1O43435 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX1O43435 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX1O43435 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX1O43435 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX1O43435 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX1O43435 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX1O43435 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX1O43435 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX1O43435 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX1O43435 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX1O43435 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX1O43435 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TBX1O43435 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX1O43435 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX1O43435 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX1O43435 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX1O43435 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX1O43435 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX1O43435 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX1O43435 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX1O43435 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms