Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEFVO15553 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEFVO15553 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEFVO15553 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEFVO15553 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MEFVO15553 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEFVO15553 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEFVO15553 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEFVO15553 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEFVO15553 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEFVO15553 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEFVO15553 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEFVO15553 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEFVO15553 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEFVO15553 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEFVO15553 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEFVO15553 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEFVO15553 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEFVO15553 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEFVO15553 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEFVO15553 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MEFVO15553 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEFVO15553 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEFVO15553 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEFVO15553 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEFVO15553 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MEFVO15553 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEFVO15553 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEFVO15553 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEFVO15553 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEFVO15553 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEFVO15553 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEFVO15553 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEFVO15553 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEFVO15553 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MEFVO15553 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEFVO15553 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MEFVO15553 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEFVO15553 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MEFVO15553 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEFVO15553 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEFVO15553 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEFVO15553 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MEFVO15553 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MEFVO15553 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MEFVO15553 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MEFVO15553 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MEFVO15553 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MEFVO15553 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MEFVO15553 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEFVO15553 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEFVO15553 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MEFVO15553 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEFVO15553 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MEFVO15553 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEFVO15553 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEFVO15553 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MEFVO15553 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEFVO15553 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEFVO15553 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEFVO15553 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEFVO15553 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEFVO15553 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEFVO15553 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEFVO15553 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MEFVO15553 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEFVO15553 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MEFVO15553 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEFVO15553 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEFVO15553 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MEFVO15553 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEFVO15553 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEFVO15553 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEFVO15553 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEFVO15553 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MEFVO15553 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
MEFVO15553 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEFVO15553 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEFVO15553 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEFVO15553 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEFVO15553 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEFVO15553 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MEFVO15553 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEFVO15553 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEFVO15553 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEFVO15553 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEFVO15553 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEFVO15553 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MEFVO15553 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEFVO15553 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEFVO15553 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEFVO15553 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEFVO15553 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MEFVO15553 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MEFVO15553 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEFVO15553 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEFVO15553 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEFVO15553 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MEFVO15553 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEFVO15553 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms