Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN2DO15399 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2DO15399 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN2DO15399 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIN2DO15399 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms