Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A1O15245 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC22A1O15245 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC22A1O15245 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms