Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TO15178 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TO15178 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TO15178 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TO15178 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TO15178 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TO15178 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TO15178 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TO15178 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TO15178 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TO15178 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TO15178 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TO15178 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TO15178 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TO15178 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TO15178 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TO15178 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TO15178 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TO15178 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TO15178 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TO15178 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TO15178 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TO15178 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TO15178 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TO15178 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TO15178 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TO15178 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TO15178 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TO15178 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TO15178 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TO15178 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TO15178 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TO15178 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TO15178 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TO15178 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TO15178 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TO15178 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TO15178 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TO15178 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TO15178 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TO15178 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TO15178 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TO15178 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TO15178 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TO15178 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TO15178 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TO15178 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TO15178 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TO15178 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TO15178 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TO15178 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TO15178 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TO15178 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TO15178 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TO15178 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TO15178 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TO15178 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TO15178 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TO15178 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TO15178 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TO15178 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TO15178 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TO15178 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TO15178 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TO15178 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TO15178 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TO15178 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TO15178 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TO15178 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TO15178 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TO15178 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TO15178 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TO15178 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TO15178 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TO15178 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TO15178 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TO15178 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TO15178 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TO15178 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TO15178 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TO15178 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TO15178 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TO15178 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TO15178 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TO15178 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TO15178 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TO15178 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TO15178 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TO15178 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TO15178 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TO15178 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TO15178 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TO15178 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TO15178 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TO15178 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TO15178 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TO15178 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TO15178 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TO15178 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TO15178 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms