Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
N4BP3O15049 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
N4BP3O15049 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP3O15049 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.57■■■□□ 2
N4BP3O15049 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP3O15049 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP3O15049 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP3O15049 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
N4BP3O15049 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP3O15049 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP3O15049 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP3O15049 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP3O15049 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP3O15049 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP3O15049 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP3O15049 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
N4BP3O15049 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP3O15049 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP3O15049 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP3O15049 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP3O15049 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP3O15049 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP3O15049 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
N4BP3O15049 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP3O15049 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP3O15049 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP3O15049 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP3O15049 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP3O15049 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
N4BP3O15049 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP3O15049 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
N4BP3O15049 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.53■■■□□ 2
N4BP3O15049 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP3O15049 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP3O15049 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
N4BP3O15049 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms