Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IKBKBO14920 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IKBKBO14920 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IKBKBO14920 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IKBKBO14920 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IKBKBO14920 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IKBKBO14920 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IKBKBO14920 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
IKBKBO14920 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IKBKBO14920 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IKBKBO14920 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IKBKBO14920 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IKBKBO14920 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IKBKBO14920 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IKBKBO14920 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IKBKBO14920 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IKBKBO14920 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IKBKBO14920 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IKBKBO14920 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IKBKBO14920 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms