Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NFKBIEO00221 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFKBIEO00221 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NFKBIEO00221 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NFKBIEO00221 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NFKBIEO00221 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NFKBIEO00221 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms