Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC188H7C350 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC188H7C350 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC188H7C350 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC188H7C350 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC188H7C350 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms