Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZ34

SHISA8, Putative protein shisa-8, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA8B8ZZ34 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHISA8B8ZZ34 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHISA8B8ZZ34 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHISA8B8ZZ34 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms