Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF3BA8MYP8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ODF3BA8MYP8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ODF3BA8MYP8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ODF3BA8MYP8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms