Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSTM2BA6NLU5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSTM2BA6NLU5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VSTM2BA6NLU5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM2BA6NLU5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms