Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC85CA6NKD9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC85CA6NKD9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC85CA6NKD9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC85CA6NKD9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC85CA6NKD9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85CA6NKD9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85CA6NKD9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85CA6NKD9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85CA6NKD9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC85CA6NKD9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC85CA6NKD9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.6 ms