Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBY3A6NI87 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBY3A6NI87 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBY3A6NI87 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms