Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC160A6NGH7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC160A6NGH7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC160A6NGH7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms