Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TLCD2A6NGC4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLCD2A6NGC4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TLCD2A6NGC4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms