Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE3

EFCAB10, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB10A6NFE3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB10A6NFE3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EFCAB10A6NFE3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFCAB10A6NFE3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB10A6NFE3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB10A6NFE3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB10A6NFE3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFCAB10A6NFE3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms