Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
USP17L4A6NCW7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP17L4A6NCW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L4A6NCW7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP17L4A6NCW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms