Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT87PA6NCN2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT87PA6NCN2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT87PA6NCN2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms