Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWA3AA6NCI4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VWA3AA6NCI4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VWA3AA6NCI4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWA3AA6NCI4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms