Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C5orf49A4QMS7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C5orf49A4QMS7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C5orf49A4QMS7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C5orf49A4QMS7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms