Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A087X0B3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A087X0B3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A087X0B3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms