Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HIF1AQ16665 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HIF1AQ16665 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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