Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP4S1Q9Y587 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP4S1Q9Y587 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4S1Q9Y587 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4S1Q9Y587 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms