Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP3Q9Y446 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP3Q9Y446 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKP3Q9Y446 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKP3Q9Y446 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms