Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R4

DDX52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX52Q9Y2R4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-12■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 INS-IGF2-201ENST00000356578 1706 ntTSL 520.87■□□□□ 0.932e-12■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-12■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.774e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.394e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-213ENST00000471793 1779 ntTSL 222.06■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 28.2
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DDX52Q9Y2R4 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-212ENST00000462201 1122 ntTSL 310.3□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-216ENST00000492782 711 ntTSL 27.2□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 IKZF1-208ENST00000426121 201 ntTSL 1 (best)6.55□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.623e-6■■■■■ 28.2
DDX52Q9Y2R4 CIC-208ENST00000575839 335 ntTSL 518.45■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.884e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-210ENST00000432179 572 ntTSL 416.81■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.144e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-220ENST00000620862 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 FBXO11-209ENST00000492225 2216 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.131e-12■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.981e-12■■■■■ 28.1
DDX52Q9Y2R4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 28
DDX52Q9Y2R4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 28
DDX52Q9Y2R4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 28
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DDX52Q9Y2R4 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 322.77■■□□□ 1.245e-6■■■■■ 28
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DDX52Q9Y2R4 EIF4A1-206ENST00000577929 696 ntTSL 222.2■■□□□ 1.141e-16■■■■■ 28
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DDX52Q9Y2R4 DGCR8-208ENST00000495351 508 ntTSL 416.74■□□□□ 0.277e-9■■■■■ 28
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DDX52Q9Y2R4 PTP4A2-202ENST00000468531 830 ntTSL 37.23□□□□□ -1.257e-9■■■■■ 28
DDX52Q9Y2R4 PTP4A2-207ENST00000494444 678 ntTSL 54.66□□□□□ -1.667e-9■■■■■ 28
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DDX52Q9Y2R4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.652e-6■■■■■ 27.9
DDX52Q9Y2R4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.62e-6■■■■■ 27.9
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DDX52Q9Y2R4 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 27.7
DDX52Q9Y2R4 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 27.7
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DDX52Q9Y2R4 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 27.7
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DDX52Q9Y2R4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 27.6
DDX52Q9Y2R4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 27.6
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DDX52Q9Y2R4 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 27.6
DDX52Q9Y2R4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -03e-6■■■■■ 27.6
DDX52Q9Y2R4 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 27.6
DDX52Q9Y2R4 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC9.25□□□□□ -0.937e-10■■■■■ 27.4
DDX52Q9Y2R4 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 27.4
DDX52Q9Y2R4 AC004801.4-201ENST00000546738 3112 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 27.4
DDX52Q9Y2R4 VMP1-213ENST00000591877 791 ntTSL 38.86□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 27.4
DDX52Q9Y2R4 VMP1-208ENST00000588617 884 ntTSL 48□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 27.4
DDX52Q9Y2R4 VMP1-215ENST00000592619 838 ntTSL 56.67□□□□□ -1.345e-7■■■■■ 27.4
DDX52Q9Y2R4 VMP1-205ENST00000587470 995 ntTSL 24.29□□□□□ -1.725e-7■■■■■ 27.4
DDX52Q9Y2R4 VMP1-216ENST00000592790 4325 nt3.81□□□□□ -1.85e-7■■■■■ 27.4
DDX52Q9Y2R4 VMP1-212ENST00000591782 729 ntTSL 53.57□□□□□ -1.845e-7■■■■■ 27.4
DDX52Q9Y2R4 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 27.4
DDX52Q9Y2R4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.893e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.743e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.65■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 BCL2L11-205ENST00000393252 482 ntTSL 232.81■■■□□ 2.844e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 27.3
DDX52Q9Y2R4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 27.2
DDX52Q9Y2R4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 27.2
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