Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP8A1Q9Y2Q0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP8A1Q9Y2Q0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms