Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A6Q9Y2P4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC27A6Q9Y2P4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A6Q9Y2P4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A6Q9Y2P4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms