Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.24■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC59.23■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.23■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC59.23■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.23■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC59.22■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC59.22■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC59.21■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC59.21■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC59.2■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.2■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC59.19■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC59.19■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC59.19■■■■■ 7.07
NISCHQ9Y2I1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.18■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC59.17■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC59.17■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.16■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC59.16■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC59.16■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.15■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC59.15■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC59.15■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC59.15■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC59.13■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC59.13■■■■■ 7.06
NISCHQ9Y2I1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC59.11■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC59.11■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC59.11■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.09■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC59.09■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.09■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC59.08■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC59.07■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC59.07■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC59.07■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC59.07■■■■■ 7.05
NISCHQ9Y2I1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC59.05■■■■■ 7.04
NISCHQ9Y2I1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.03■■■■■ 7.04
NISCHQ9Y2I1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC59.03■■■■■ 7.04
NISCHQ9Y2I1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC59.02■■■■■ 7.04
NISCHQ9Y2I1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC59.01■■■■■ 7.04
NISCHQ9Y2I1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC59.01■■■■■ 7.04
NISCHQ9Y2I1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC59■■■■■ 7.04
NISCHQ9Y2I1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC58.99■■■■■ 7.03
NISCHQ9Y2I1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.99■■■■■ 7.03
NISCHQ9Y2I1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC58.98■■■■■ 7.03
NISCHQ9Y2I1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.98■■■■■ 7.03
NISCHQ9Y2I1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC58.98■■■■■ 7.03
NISCHQ9Y2I1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC58.97■■■■■ 7.03
NISCHQ9Y2I1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC58.95■■■■■ 7.03
NISCHQ9Y2I1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC58.95■■■■■ 7.03
NISCHQ9Y2I1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC58.94■■■■■ 7.03
NISCHQ9Y2I1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.94■■■■■ 7.03
NISCHQ9Y2I1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.93■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC58.93■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC58.92■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC58.9■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC58.9■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC58.9■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.89■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC58.89■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC58.89■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC58.88■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC58.88■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.88■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC58.87■■■■■ 7.02
NISCHQ9Y2I1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.87■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC58.87■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC58.86■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC58.86■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.85■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC58.84■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.83■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.83■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC58.83■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.82■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC58.82■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.82■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC58.82■■■■■ 7.01
NISCHQ9Y2I1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC58.8■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC58.79■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.79■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.79■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC58.79■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC58.78■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC58.78■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.78■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.77■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.75■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.75■■■■■ 7
NISCHQ9Y2I1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.75■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC58.74■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC58.73■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC58.73■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.73■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC58.72■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC58.72■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC58.71■■■■■ 6.99
NISCHQ9Y2I1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC58.71■■■■■ 6.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms