Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPSEQ9Y251 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPSEQ9Y251 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPSEQ9Y251 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPSEQ9Y251 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPSEQ9Y251 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HPSEQ9Y251 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPSEQ9Y251 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms