Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOD1Q9Y239 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOD1Q9Y239 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NOD1Q9Y239 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NOD1Q9Y239 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOD1Q9Y239 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms