Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPN11Q9UMQ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN11Q9UMQ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN11Q9UMQ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN11Q9UMQ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms