Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
TNIKQ9UKE5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TNIKQ9UKE5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC41■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC41■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TNIKQ9UKE5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
TNIKQ9UKE5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
TNIKQ9UKE5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.79■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TNIKQ9UKE5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms