Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX20Q9UHI6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX20Q9UHI6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX20Q9UHI6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDX20Q9UHI6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.2 ms