Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNG4Q9UBN1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNG4Q9UBN1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNG4Q9UBN1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNG4Q9UBN1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNG4Q9UBN1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms