Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP36Q9P275 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP36Q9P275 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP36Q9P275 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms